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HT-BSP助力表观遗传学研究！
目前，大家研究比较普遍集中在DNA甲基化检测上，如检测某一个或几个基因的甲基化水平，这时采用高通量甲基化芯片或测序，通量太高，过于浪费；而采用传统的焦磷酸测序、T-BSP、MSP一次性只能检测个别甲基化位点，麻烦费事，也不合适。这时候HT-BSP应运而生，可以检测多个基因任何位置的甲基化水平，既适用于一些甲基化检测区域已知的基因，也适用于探索基因的显著甲基化区域
2022-01-05
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gene expression omnibus（高通量基因表达）
GEO也可指gene expression omnibus（高通量基因表达）。GEO DataSets 储存由 Gene Expression Omnibus (GEO) repository中得来的基因表达以及分子丰富性的数据。GEO Profiles 储存单独的由 Gene Expression Omnibus (GEO) repository中 得来的基因表达以及分子丰富性的数据。对挡案的搜索建立在基因注释和事先计算的档案特性的基础上，并能连接到很多其他相关资源。
2022-01-05
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lncTCF7通过激活Wnt通路调控肝癌
LncRNA介导的生物学已经牵涉于许多细胞过程。在癌症中，lncRNAs可作为转录调控因子与染色质重塑复合物（SWI / SNF复合物）协作发挥功能。SWI/ SNF复合物参与哺乳动物干细胞自我更新和分化过程。然而，肿瘤干细胞中SWI / SNF复合物功能是什么仍然不太清楚。研究小组在线发表了一项新研究论文，首次发现了一个新的非编码RNA—— lncTCF7, 它可以募集SWI / SNF复合物到TCF7的启动子区域来调节其表达，从而激活Wnt信号通路，进一步促进肝癌干细胞的自我更新。
2022-01-05
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lncRNA功能探究的新方法
lncRNA研究近来非常火热，但由于研究领域太前沿，成熟的技术方法、实验工具不多，很多研究者不知如何下手。cis调控就是其中一个重要方向，长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RNA。研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应(Dosage compensationeffect)、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，成为遗传学研究热点
넶0 2022-01-05 -
肾癌细胞中以外泌体形式转运的lncAR
是常用的肾细胞癌临床治疗选择。然而，临床数据显示，有10%-20%的病人显示出对苏尼替尼的药物抗药性。临床上舒尼替尼治疗肾癌往往出现药物耐受，原因是什么呢？lncRNA在这个过程中又扮演了什么样的角色？课题组发现了一个舒尼替尼耐药特异性的长链非编码RNA——lncARSR，它可以以外泌体的形式转运，并通过ceRNA的方式竞争性结合miR-34/miR-449调控AXL和c-Met，从而调控舒尼替尼耐药性.
넶0 2022-01-05 -
HT-BSP助力表观遗传学研究！
目前，大家研究比较普遍集中在DNA甲基化检测上，如检测某一个或几个基因的甲基化水平，这时采用高通量甲基化芯片或测序，通量太高，过于浪费；而采用传统的焦磷酸测序、T-BSP、MSP一次性只能检测个别甲基化位点，麻烦费事，也不合适。这时候HT-BSP应运而生，可以检测多个基因任何位置的甲基化水平，既适用于一些甲基化检测区域已知的基因，也适用于探索基因的显著甲基化区域
넶0 2022-01-05 -
免疫研究新启示—蛋白修饰+转录因子
先天淋巴细胞组3（ILC3s）可以通过促进淋巴器官和增强免疫反应来抵抗细菌感染。有研究表明ILC3谱系受转录因子调控，同时前期研究也发现谷氨酰化参与免疫应答的调节，但转录因子和谷氨酰胺化如何调节ILCs的发育和维持还不是很清楚。课题组在线发表了一项研究论文，发现IL-7Rα可以被TTLL4和TTLL13谷氨酰化，并被CCP2去谷氨酰化。IL-7Rα的谷氨酰化促进STAT5激活启动转录因子Sall3的表达，终促进ILC3s的发生。IL-7Rα的谷氨酰化和去谷氨酰化严密控制着ILC3s的发展和效应功能。
넶0 2022-01-05
